根据工作原理来分，筷子消毒机大致上可分为机械式筷子消毒机与自动式筷子消毒机。

  (1)机械式筷子消毒机

  机械式筷子消毒机是需要进行手工操作的，即筷子是需要人工取出的。比如在筷子消毒结束后，当客人取走了所有的筷子后，需要按压一下消毒机侧面的出筷按钮。如果不按，消毒机是出不了筷子的，而且筷子用完后也不会启动提醒装置。

  (2)自动式筷子消毒机

  自动式筷子消毒机是全智能控制的，使用过程中无需人工辅助。当人们把筷子放入消毒机内，接通电源后，按开始按钮后，该消毒机就可以自动工作。另外，因为消毒机在设计上采用了人机对话模式，所以其消毒时间是由使用者决定的，其消毒过程可以通过LED显示。自动式筷子消毒机在筷子取完后，机器可以启动自动提醒，直到装入新筷子为止。

  目前，市面上的筷子消毒机大多采用的都是臭氧消毒方式，因为这种消毒方式安全方便，限制也少。筷子消毒机主要是利用高压电路和放电设施将空气中的氧气电离，然后合成臭氧分子。臭氧分子因为氧化性强，可以瞬间杀死细菌、病毒，从而起到了消毒效果。另外，由于臭氧分子不稳定，消毒后可以合成稳定的氧气分子，所以全程无污染，无残留。

  所有的筷子消毒机是集消毒、存储、输出为一体的消毒设备，因为其不具备清洗功能，所以消毒前筷子需要清洗干净，但是要擦干后才能放入，以防水滴入消毒机箱体，影响消毒机的正常使用。